Na jornada do tratamento do câncer, a detecção precoce sempre foi um desafio. Nos últimos anos, a técnica de biópsia líquida tem recebido muita atenção devido à sua natureza não invasiva e alta sensibilidade. No entanto, as técnicas de detecção existentes dependem em grande parte do sequenciamento direcionado profundo, dificultando a integração de vários tipos de dados, o que afeta a sensibilidade e a especificidade.
Para superar essa limitação técnica, uma equipe de pesquisa da Universidade de Oxford desenvolveu um novo método de detecção multimodal de DNA tumoral circulante (ctDNA), baseado no sequenciamento de piridina-borano assistido por TET (TAPS) de genoma inteiro. O maior destaque deste método é a capacidade de analisar simultaneamente dados genômicos e de metilação, aumentando a sensibilidade do diagnóstico de câncer para 94,9% e a especificidade para 88,8%. Essa tecnologia inovadora oferece novas possibilidades para a triagem precoce do câncer e a estratificação de pacientes.
O estudo, intitulado "Multimodal cell-free DNA whole-genome TAPS is sensitive and reveals specific cancer signals", foi publicado em 8 de janeiro de 2025 na revista Nature Communications. O contexto do estudo mostra que, embora a detecção precoce do câncer seja crucial para melhorar o prognóstico do paciente, os métodos de triagem atuais cobrem menos de 30% dos tipos de câncer, e muitos métodos exigem procedimentos invasivos, resultando em baixa aceitação. Embora as tecnologias de detecção precoce de múltiplos tipos de câncer permitam a detecção não invasiva, elas frequentemente apresentam altas taxas de falsos positivos em indivíduos assintomáticos, limitando sua aplicação.
A tecnologia TAPS da equipe de Oxford, por meio de um método não destrutivo, consegue manter alta sensibilidade mesmo com baixo teor de ctDNA. Os pesquisadores validaram a precisão deste método em vários tipos de câncer por meio do sequenciamento profundo de amostras de 61 pacientes com câncer e 30 controles sem câncer.
A equipe também desenvolveu um processo de análise de dados multimodais que integra variações no número de cópias, mutações somáticas e sinais de metilação para melhorar a sensibilidade da detecção de ctDNA. Os resultados mostraram que, em amostras clínicas, a sensibilidade de detecção deste método atingiu 85,2%, muito superior aos resultados de um único modo de dados.
Embora este método demonstre vantagens significativas na detecção precoce do câncer e no monitoramento pós-operatório, ainda enfrenta desafios na aplicação prática, como o alto custo do sequenciamento e os recursos limitados em ambientes clínicos. Pesquisas futuras podem otimizar ainda mais a tecnologia de sequenciamento para expandir sua aplicabilidade a mais tipos de câncer.