谷歌 DeepMind 近日意外发布了 AlphaFold3的源代码和模型权重，标志着一个可能加速科学发现和药物开发的重大进展。这一消息传出仅几周后，系统的创造者 Demis Hassabis 和 John Jumper 便获得了2024年诺贝尔化学奖，以表彰他们在蛋白质结构预测方面的贡献。与前一版本 AlphaFold2相比，AlphaFold3的技术能力有了质的飞跃。AlphaFold2只能预测蛋白质的结构，而 AlphaFold3则可以建模蛋白质、DNA、RNA 及小分子之间复杂的相互作用，这是生命的基本过程。这一进展至关重要，因为理解这些分子相互作用是现代药

AlphaFold3作为生物科学与计算机科学的交汇点上的重要突破，由谷歌DeepMind发布，但因未提供代码或模型权重，引发科学界复现热潮。Ligo初创公司成为首个成功复现AlphaFold3的团队，三位创始人均为牛津大学本科生，仅用四个月便实现了这一壮举，展现科学潜力。此成果被视为生物科学领域里程碑，尤其在蛋白质结构预测方面潜力巨大。然而，DeepMind的“闭门造车”策略受到批评，模型仅在特定服务器上供有限调用。面对此情况，Ligo团队决定开源其复现模型，不仅遵循原有模型架构，还进行优化和创新，使用8个A100GPU高效训练，展现了科研合作与创新的活力。除Ligo外，哥伦比亚大学OpenFold团队和独立开发者Phil Wang也参与了这一开源运动，形成了活跃的科研生态。